- Plateforme de PCR Quantitative à Haut Débit Genomic Paris Centre

Plateforme de PCR Quantitative à Haut Débit

Présentation

La plateforme qPCR-HD-GPC propose aux équipes de recherche publiques et privées, ainsi qu’aux industries, une expertise et des méthodes pour l’analyse quantitative à haut débit du génome et du transcriptome. Les technologies microfluidiques implantées sur la plateforme permettent d’aborder toutes les méthodes de PCR quantitative et digitale pour réaliser des analyses génomiques de type :

- - Variation d’expression (GE)
  - Variation du nombre de copies (CNV)
  - Recherche de polymorphismes (SNP)
  - Génotypage
  - Préparation et quantification de banques pour séquençage haut débit
  - Génomique/Trancriptomique de la cellule unique
  - Quantification absolue (dPCR et cdPCR)

Présentation

Workflow général

Schéma des prestations proposées sur la Plateforme

qPCR en microfluidique

PCR digitale

Actualités

Publications

Historique

C’est en septembre 2013 que la plateforme qPCR-HD-GPC a été ouverte pour réaliser des prestations de PCR quantitative à haut débit accessibles à toute la communauté scientifique. La plateforme s’intègre alors dans le réseau des plateformes technologiques de la Montagne Sainte-Geneviève et propose de nouvelles capacités d’analyses génomiques quantitatives en lien avec les services existants de séquençage à haut débit (ENS et Institut Curie, Microdissection Laser (Collège de France) et Cytométrie de flux (ENS et Institut Curie).

Labels

La plateforme est labellisée IBiSA depuis 2018 (label renouvelé en 2021) et fait partie du consortium Genomic Paris Centre, qui regroupe les plateformes de Génomique et de qPCR à Haut Débit de l’ENS.

Genomic Paris Centre fait partie du noyau central de l’Infrastructure France Génomique depuis mai 2020.

Dans ce sens, nos objectifs sont de :

Rendre les technologies d’analyses génomiques quantitatives accessibles à tous les laboratoires
Accompagner les équipes de recherche dans la réussite de leurs projets
Diffuser les approches à grande échelle en génomique quantitative et fonctionnelle au sein de la communauté scientifique
Former et informer sur les avancées du domaine

ans (depuis 2013)

Publications associées

Projets

Ingénieurs

Qui, quoi et comment ?

La plateforme qPCR-HD-GPC est animée par un ingénieur biologiste et un ingénieur plateforme. La plateforme dispose du système Biomark-HD^TM de Fluidigm pour les PCR quantitative et digitale en microfluidique, et du système Naica^TM de Stilla Technologies pour la PCR digitale en nanogouttelettes à haute résolution (cdPCR).

Nous proposons un système d’accompagnement de projets pour lesquels la plateforme participe au dessin expérimental et prend en charge l’ensemble du processus expérimental et analytique afin de fournir des résultats prêts à être publiés. Les échantillons sont pris en charge sous forme de tissus, cellules uniques, ADN génomique, ADN environnemental, ARN, micro ARN, ou ADN complémentaire.